Về mưa, từ đêm 24/9, Quảng Ninh, Lạng Sơn, Hải Phòng bắt đầu xuất hiện mưa dông rải rác, từ trưa 25/9, khu vực đồng bằng Bắc Bộ, Tây Bắc Bộ, trong đó có Thủ đô Hà Nội mưa tăng dần. Mưa cũng mở rộng ra Thanh Hoá - Nghệ An trong ngày 25-26/9.
Dự báo tổng lượng mưa ở miền Bắc, Thanh Hoá và Nghệ An từ đêm 24/9 đến hết đêm 26/9 khoảng 150-300mm, có nơi trên 450mm. “Chúng tôi đặc biệt lưu ý, mưa lớn có thể xảy ra ở phần sườn đông của dãy Hoàng Liên Sơn thuộc hai tỉnh Lào Cai và Yên Bái cũ”, ông Lâm nói. Đây là khu vực có nhiều hồ chứa thuỷ điện hoạt động.
Do mưa lớn kéo dài, dự báo từ ngày 25/9 đến 27/9, trên các sông ở khu vực Bắc Bộ, Thanh Hóa, Nghệ An có khả năng xuất hiện một đợt lũ.
Đỉnh lũ trên sông Thao và các sông nhỏ có khả năng lên mức BĐ2-BĐ3, đỉnh lũ trên sông Lô, thượng lưu sông Thái Bình, sông Hoàng Long, sông Bưởi, thượng lưu sông Mã lên mức BĐ1-BĐ2, có sông trên BĐ2, nguy cơ ngập úng nơi trũng, thấp, lũ quét trên các sông, suối nhỏ và sạt lở đất trên sườn dốc.